MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5II

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010123	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010123	CGGG	2	8	1829	1836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010123	T	6	6	1837	1842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010123	TTC	2	6	1857	1862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010123	CTGA	2	8	1921	1928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010123	CGA	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010123	GCC	2	6	1978	1983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010123	CGGC	2	8	1999	2006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010123	TCG	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010123	GCA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010123	CGT	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010123	CGC	2	6	2176	2181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010123	CGG	2	6	2197	2202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010123	GCT	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010123	CTT	2	6	3356	3361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010123	CGA	3	9	3384	3392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010123	C	6	6	3442	3447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_010123	CCAGA	2	10	4227	4236	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010123	TCG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010123	AGGT	2	8	4321	4328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010123	CGA	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010123	CAG	2	6	8024	8029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010123	CAA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010123	GTT	2	6	8142	8147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010123	GGTG	2	8	8155	8162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010123	GC	3	6	10192	10197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010123	GC	3	6	10199	10204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010123	AAGGCA	2	12	10256	10267	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010123	CGCC	2	8	10299	10306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_010123	CGT	2	6	10332	10337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010123	CAA	2	6	10427	10432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010123	T	6	6	11116	11121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010123	CCCG	2	8	11222	11229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_010123	CGAGGC	2	12	11240	11251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010123	CTG	2	6	11592	11597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010123	GCG	2	6	11605	11610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010123	ACC	2	6	11611	11616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010123	GCGA	2	8	11647	11654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010123	CGG	3	9	11692	11700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010123	GAA	2	6	11745	11750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010123	GAC	2	6	11757	11762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010123	GGT	2	6	11826	11831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010123	GAC	2	6	11956	11961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010123	GGC	2	6	12041	12046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010123	GCCG	2	8	12107	12114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010123	CG	3	6	12749	12754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010123	AGG	2	6	13297	13302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010123	GC	3	6	13335	13340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010123	ATA	2	6	13364	13369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010123	GCC	2	6	13770	13775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010123	GCG	2	6	13836	13841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010123	GCC	2	6	13918	13923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010123	ATT	2	6	14600	14605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010123	GCG	3	9	14609	14617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010123	TGG	2	6	15582	15587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010123	ATT	2	6	15591	15596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010123	CAC	2	6	15633	15638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010123	ACG	2	6	15648	15653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010123	ACA	2	6	15677	15682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010123	AG	3	6	15689	15694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010123	CATA	2	8	16571	16578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010123	CAC	2	6	16584	16589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010123	AACA	2	8	16601	16608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.